先后在Theoretical and Applied Genetics、Molecular Breeding、Plant Breeding、Nature Biotechnology、植物學報、遺傳學報等國內外刊物上發表論文30余篇。
出版專著：
1、《遺傳學實驗》 華中農業大學教務處出版 2003
2、《遺傳學》 中國農業大學出版社出版 2007
3、《綠色超級稻的構想與實踐》 科學出版社 2009
發表論文：
英文：
1. Liu W, Zeng J , Jiang G, He YQ, QTLs identification of crude fat content in brown rice and its genetic basis analysis using DH and two backcross populations,Euphytica, 2009,169(2):197-205
2. Wang GW, Cai HY, Xu Yunbi, Yang SH, He YQ. Analysis on the spectra and level of wide-compatibility conferred by three neutral alleles in inter-subspecific hybrids of rice (Oryza sativa L.) using near isogenic lines, Plant Breeding,2009,128(5):451-457
3. Wang L, Zhong M, Li X, Yuan D, Xu Y, Liu H，He Y, Luo L, Zhang Q. The QTL controlling amino acid content in grain of rice (Oryza sativa) were co-localized with the regions involved in amino acid metabolism pathway. Molecular Breeding, 2008: 21(1): 127-137
4. Li YB, Wu C, Jiang G, He Y. Dynamic QTL analysis for rice blast resistance under natural infection conditions，Australian Journal of Crop Science，2008：273-82
5. Li Y, Wu C, Jiang G and He Y. Dynamic analyses of rice blast resistance for the assessment of genetic and environmental effects. Plant Breeding 2007,126,541-547.
6. Wang LQ, Liu WJ, Xu Y, He YQ, Luo LJ, Xing YZ, Xu CG, Zhang Qifa. Genetic basis of 17 traits and viscosity parameters characterizing the eating and cooking quality of rice grain. Theor Appl Genet. 2007,115,463-476
7. Wang G, He Y, Xu C and Zhang Q. Fine mapping of f5-Du, a gene conferring wide-compatibility for pollen fertility in inter-subspecific hybrids of rice. Theor Appl Genet. 2006,112(2):382-387
8. Zhang JF, Li X, Jiang G, Xu Y, Li X, He Y，Pyramiding of Xa7 and Xa21 for the improvement of disease resistance to bacterial blight in hybrid rice，Plant Breeding，2006，125, 600-605
9. Ge X, Xing Y, Xu C, He Y. QTL analysis of cooked rice grain elongation, volume expansion and water absorption using a recombinant inbred population. Plant Breeding，2005,124:121-126
10. Tian R, Jiang G, Shen L, Wang L, He Y. Mapping quantitative trait loci underlying the cooking and eating quality of rice grains using a DH population. Molecular Breeding, 2005,15:117-124.
11. Wang G, He Y, Xu C, Zhang Q. Identification and confirmation of three neutral alleles conferring wide compatibility in inter-subspecific hybrids of rice (Oryza sativa L.) using near-isogenic lines. Theor Appl Genet, 2005, 111:702–710
12. Jiang G, Hong X, Xu C, Li X and He Y. Identification of Quantitative Trait Loci for Grain Appearance and Milling Quality Using a Doubled-Haploid Rice Population. Journal of Integrative Plant Biology,2005, 47 (11): 1391−1403
13. Jiang G H, Xu C G, Tu J M, He YQ, Zhang Q. Pyramiding of Insect- and disease-resistance genes into an elite indica cytoplasm male sterile(CMS) restorer line ‘Minghui 63’. Plant Breed, 2004,123(2):112-116
14. Jiang G H, Xu C G, Li X H, He YQ. Characterization of genetic basis for tHe Yield and its component traits of rice using doubled haploid population. Acta Genet Sinica, 2004,31(1):63-72
15. Jiang GH, He YQ, Xu CG, Li XH, Zhang Q. The genetic basis of stay-green in rice analyzed in a population of doubled haploid lines derived from an indica by japonica cross. Theor Appl Genet，2004,108:688–698
16. Zhou PH, Tan YF, He YQ, Xu CG, Zhang QF. Simultaneous improvement for four quality trait of Zhenshan 97, an elite parent of hybrid rice, by molecular marker-assisted selection. Theor Appl Genet, 2003, 106:326-331
17. Liu S, Li X, Wang C, Li X, He Y. Improvement of resistance to rice blast in Zhenshan 97 by molecular marker-aided selection. Acta Botannica Sinica, 2003，45(11):1346-1350
18. Tu, J., G. Zhang, K. Datta, C. Xu, Y. He, Q. Zhang, G. S. Khush and S. K. Datta. Field performance of transgenic elite commercial hybrid rice expressing Bacillus thuringiensis d-endotoxin. Nature Biotechnology, 2000,18:1101-1104
19. He YQ, Xu C G, Zhang Z G, Yang Q, Zhang Q. The genetic basis of the male sterility of instability and reversibility of PSGMS using molecular marker analysis in indica rice. Theor Appl Genet. 1999,96(4):526-538
20. Li RH, Xu CG, Yuan LP, He YQ, Sun CQ, Yu SB, Li XH, Wang XK. Differentiation and classification of parental lines and favorable genic interactions affecting F1 fertility in distant crosses of rice (Oryza sativa L). Theor Appl Genet, 1998, 96: 526–538
中文：
1 利用分子標記輔助選擇改良培矮64S的稻瘟病抗性 董巍; 李信; 晏斌; 吳昌軍; 高冠軍; 包亮; 李一博; 朱雪萍; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室國家農作物分子育種中心 2010-09-28
2 利用水稻重組自交系進行配合力遺傳分析 付新民; 王巖; 高冠軍; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 2010-08-15
3 利用DH群體定位白葉枯病抗性QTL 張劍霞; 楊子賢; 姜恭好; 高冠軍; 何予卿 湖北武漢華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 2009-05-28
4 分子標記輔助選擇改良優質水稻恢復系明恢63的稻米品質 王巖; 付新民; 高冠軍; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家植物基因研究中心 2009-07-28
5 利用秈粳交探討水稻株高和抽穗期的遺傳基礎 曾晶; 姜恭好; 何予卿; 張端品 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 國家植物基因研究中心; 國家農作物分子育種中心; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家植物基因研究中心 2006-07-28
6 利用2個相關群體定位和比較水稻株高與抽穗期QTL 劉文俊; 王令強; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 武漢 2007-04-15
7 利用RIL群體比較定位糙米和精米蛋白質含量的QTL 鐘明; 王令強; 羅利軍; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 國家植物基因研究中心; 國家農作物分子育種中心; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家植物基因研究中心; 上海市農業生物基因中心 2007-10-15
8 廣譜抗稻瘟病基因d12的遺傳分析及分子標記輔助選擇應用 包亮; 李一博; 高冠軍; 何予卿 華中農業大學生命科學學院; 作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家植物基因研究中心（武漢） 2008-08-15
9 水稻全生育期稻瘟病抗性遺傳及其基因定位研究 高冠軍; 李桂菊; 包亮; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 湖北省宜昌市農業科學研究所 2008-09-15
10 利用分子標記輔助選擇改良珍汕97的稻瘟病抗性(英文) 劉士平; 李信; 汪朝陽; 李香花; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 武漢 2003-12-10
11 利用DH群體動態檢測水稻抗褐飛虱數量性狀基因位點 吳昌軍; 姜恭好; 李信; 劉韜; 徐才國; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家農作物分子育種技術中心; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家農作物分子育種技術中心 武漢 2005-07-28
12 基因聚合對水稻稻瘟病的抗性影響 劉士平; 李信; 汪朝陽; 李香花; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點試驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點試驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點試驗室 武漢 2003-01-28
13 水稻米飯延伸指數相關性狀的基因定位研究 何予卿; 邢永忠; 葛小佳; 李香花; 徐才國 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 國家農作物分子育種技術中心; 國家農作物分子育種技術中心 2003-11-28
14 利用雙單倍體群體剖析水稻產量及其相關性狀的遺傳基礎(英文) 姜恭好; 徐才國; 李香花; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 武漢 2004-01-10
15 利用分子標記輔助選擇改良93-11對白葉枯病和螟蟲抗性 楊子賢; 姜恭好; 徐才國; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家農作物分子技術育種中心; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 國家農作物分子技術育種中心 武漢 2004-07-28
16 利用重組自交系群體對水稻產量相關性狀的QTL分析 馬大鵬; 羅利軍; 汪朝陽; 何予卿 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 上海市農業生物基因中心; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 武漢 2004-07-28
17 Copia類型反轉錄轉座子在籽粒莧中的表現 何予卿; 孫梅; 朱英國; 張利達 香港大學動物學系; 武漢大學生命科學院; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 香港華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 2002-05-10
18 光敏核不育水稻花培變異性及其選育技術路線 何予卿; 陳亮; 徐才國 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 廈門大學生命科學院; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 2000-11-20
19 上位性對光敏核不育水稻不育性不穩定性的影響 何予卿; 徐才國 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 2000-10-30
20 利用ISSR分子標記研究栽培稻和野生稻親緣關系 何予卿; 張宇; 孫梅; 何光存; 王松文; 朱英國 武漢大學生命科學院; 香港大學動物系; 天津農學院; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 2001-06-15
21 秈型光敏核不育水稻育性可轉換性的基因定位和基因互作研究 何予卿; 徐才國 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室; 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 2001-04-30
22 兩系雜交粳稻主要親本配合力測定 何予卿; 戚華雄; 王長義 湖北省農科院糧作所; 華中農業大學生命科技學院 1995-06-30
23 秈型光敏核不育水稻育性不穩定性和育性可轉換性的遺傳研究 何予卿; 楊靜; 徐才國; 張自國; 曾漢來 華中農業大學作物遺傳改良國家重點實驗室 1998-08-25
24 水稻親本遺傳分化程度與秈粳雜種優勢的關系 李任華; 徐才國; 何予卿; 袁隆平; 王象坤 中國農業大學; 華中農業大學; 華中農業大學; 國家雜交水稻工程技術研究中心; 中國農業大學 北京; 湖北武漢; 湖南長沙 1998-10-15
25 分子標記技術原理及其在雜交水稻中的應用 何予卿; 涂巨民; 陳升; 姜恭好; 張進峰; 楊子賢; 李一博; 高冠軍; 包亮; 吳昌軍; 李信; 劉士平; 徐才國; 張啟發 全國植物分子育種研討會摘要集 2009-01-04
26 秈型水稻谷粒相關性狀的遺傳剖析 何予卿; 葛小佳; 邢永忠; 秦發蘭; 張端品 2003年全國作物遺傳育種學術研討會論文集 2003-10-01
27 利用DH群體定位控制米飯相關性狀的數量性狀位點(QTLs) 田瑞; 姜恭好; 沈麗環; 王令強; 何予卿 湖北省遺傳學會第七次代表大會暨學術討論會論文摘要集 2004-05-01
28 利用分子標記輔助選擇改良93-11對白葉枯病和螟蟲抗性 楊子賢; 姜恭好; 徐才國; 何予卿 湖北省遺傳學會第七次代表大會暨學術討論會論文摘要集 2004-05-01
29 利用分子標記聚合優良基因改良雜交水稻 何予卿; 姜恭好; 李信; 張進鋒; 楊子賢; 王功偉; 涂巨民; 陳升; 徐才國; 張啟發 湖北省遺傳學會第七次代表大會暨學術討論會論文摘要集 2004-05-01
30 籽粒莧copia類反轉錄轉座子的初步研究 江樹業; 孫梅; 何予卿; 陳洪; 陳啟鋒 福建農林大學作物科學學院; 香港大學動物學系; 香港大學動物學系; 福建農林大學作物科學學院 福建福州; 福建福州 2002-06-30
31 粳型兩系雜交水稻恢復系的選育與應用初報 王長義; 馮云慶; 戚華雄; 何予卿; 胡剛; 夏明元; 羅聲群 湖北省農科院糧作所 1994-03-30
32 兩系粳雜種子純度鑒定與防雜保純措施 王長義; 戚華雄; 何予卿; 胡剛 湖北省農科院糧作所 1995-01-30
33 兩系雜交粳稻N5088S／R187的選配與應用初報 王長義; 馮云慶; 戚華雄; 何予卿; 胡剛; 夏明元; 羅聲群 湖北省農科院糧作所 1995-03-30
34 粳型光敏核不育系N5088S選育與應用初報 王長義; 馮云慶; 夏明元; 胡剛; 戚華雄; 何予卿; 羅聲群 湖北省農科院糧食作物研究所; 湖北省農科院糧食作物研究所 1993-06-30
35 粳型光敏核不育系選育與應用初報 王長義; 馮云慶; 夏明元; 胡剛; 戚華雄; 何予卿; 羅聲群 湖北省農科院糧作所; 湖北省農科院糧作所 1993-05-01
36 粳型光敏核不育系N5088S的鑒定與評價 王長義; 馮云慶; 戚華雄; 胡剛; 何予卿; 夏明元; 羅聲群 湖北省農業科學院糧食作物研究所 1994-10-21
37 秈稻米直鏈淀粉含量的遺傳及其基因劑量效應 何予卿; 呂志仁 湖北農科院糧作所; 廣西農學院農學系 武漢 1993-10-28
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