專家信息:
姚玉峰,男,博士,上海交通大學基礎醫(yī)學院教授,上海交通大學醫(yī)學科學研究院病原細菌學實驗室課題組長,上海高校特聘教授(東方學者),博士生導師。
教育及工作經歷:
2002年于中科院上海生命科學院獲博士學位。
2002年至2007年分別在美國國立衛(wèi)生研究院和約翰霍普金斯大學醫(yī)學院從事博士后研究。
2007年作為引進人才進入上海交通大學醫(yī)學院工作。
學術兼職及社會任職:
1. 上海市微生物學會醫(yī)學微生物專業(yè)委員會委員。
2. 中國微生物學會分析微生物專業(yè)委員會委員。
3. 美國微生物學會會員。
4. Review Editor of Frontiers in Cellular and Infection Microbiology.
主講課程:
醫(yī)學本科生:《醫(yī)學微生物學》
研究生:《細胞微生物學》
培養(yǎng)研究生情況:
資料更新中……
教學成果:
參與“探究為基礎的學習”(RBL)教學改革工作,指導醫(yī)學本科生進行科研訓練,并獲得一項上海市大學生創(chuàng)新性實驗計劃。此外,長期作為咨詢專家參與上海市青少年科技活動,負責指導中小學生進行課外科研活動。
研究方向:
細菌微進化及致病機制
1. 利用高通量生物學技術研究結核分枝桿菌北京家族基因組微進化與其毒力、耐藥、傳播力以及對宿主免疫逃逸的關系。
2. 采用體外結合體內模型的方法鑒定新的結核分枝桿菌毒力因子并研究其在結核分枝桿菌致病過程中的具體功能。
3. 利用分子生物學和蛋白質組學技術研究細菌VI型分泌系統(tǒng)的結構組成以及鑒定分泌蛋白并研究其功能。
4. 細菌蛋白質乙酰化修飾與致病機制的關系。
承擔科研項目情況:
目前主持科技部“973”計劃課題、國家自然科學基金、“十一五”傳染病重大專項以及上海市科委啟明星計劃等課題。
1. 國家自然科學基金委項目,(31270173) 腸出血型大腸埃希菌VI型分泌系統(tǒng)分泌蛋白鑒定及功能研究,2013-01~~2016-12,82萬元,課題負責人。
2. 國家自然基金委項目,(31070114)結核分枝桿菌DnaA乙酰化修飾與DNA復制調控的研究,2011-01~~2013-12,35萬元,課題負責人。
3. 上海市教委項目,上海高校特聘教授(東方學者),2010-01~~2012-12,50萬元,課題負責人。
4. 科技部973計劃項目,(2009CB522605)結核桿菌微進化的研究,2009-01~~2013-12,320萬元,課題負責人。
5. 國家自然基金委項目,(30870100)細胞毒素壞死因子(CNF1)的分泌及其作用機制,2009-01~~2011-12,30萬元,課題負責人。
科研成果:
近5年來發(fā)表論文和綜述30多篇,其中SCI論文18篇。其中一篇作為第一作者發(fā)表在《Infetion&Immunity》(2006)的論文被評為美國微生物學會雜志優(yōu)秀論文,美國同微生物學會官方雜志《Microbe》專門發(fā)表了評述。申請國際和國內專利3項。
發(fā)明專利:
申請國際和國內專利3項。
資料更新中……
在J Biol Chem、J Infect Dis、Infect & Immun、Science等國際知名SCI期刊上發(fā)表研究論文近30篇,論文多次被Nat Rev Microbiol、Annu Rev Genet和Curr Opin Microbiol等高水平綜述雜志引用。
出版專著:
1. 參編《病原生物學實驗》(科學出版社,2010年)
2. 參編《醫(yī)學微生物學技術》(人民衛(wèi)生出版社,2010年)
代表性英文論文:
1 Zhou Y, Tao J, Yu H, Ni J, Zeng L, Teng Q, Kim KS, Zhao GP, Guo XK, Yao Y#. Hcp-family proteins secreted via type VI secretion system coordinately regulate Escherichia coli K1 interaction with human brain microvascular endothelial cells. Infect & Immun,2012;80(3):1243-51
2 Zhou A, Nawaz M, Xue X, Karakousis P, Yao Y#, Xu J. Molecular genotyping study of Mycobacterium tuberculosis in Xi’an, China using MIRU-VNTR typing system. Int J Tuberc Lung Dis, 2011; 15(4):517-22
3 Zhou A, Nawaz M, Duan Y, Moore J, Millar C, Xu J, Yao Y#. Molecular characterization of isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from Xi’an, China.Microbial Drug Resistance, 2011;17(2):275-81
4 Wang Q, Zhang Y, Yang C, Xiong H, Lin Y, Yao J, Li H, Xie L, Zhao W, Yao Y, Ning Z, Zeng R, Xiong Y, Guan K, Zhao S, Zhao G. Acetylation of metabolic enzymes coordinates carbon source utilization and metabolic flux. Science, 2010; 327(5968):1004-7
5 Lu LD, Sun Q, Fan XY, Zhong Y, Yao Y#, Zhao GP. Mycobacterial MazG Is A Novel NTP Pyrophosphohydrolyase Involved in Oxidative Stress Response. J Biol Chem, 2010; 285(36):28076-85
6 Yao Y, Xie Y, Perace D, Zhong Y, Lu J, Tao J, Guo X, Kim KS. The type III secretion system is involved in the invasion and intracellular survival of Escherichia coli K1 in human brain microvascular endothelial cells. FEMS Microbiol Lett, 2009; 300(1):18-24
7 Parthasarathy G, Yao Y, Kim KS. Flagella promote Escherichia coli K1 association with and invasion of human brain microvascular endothelial cells (HBMEC). Infect & Immun, 2007; 75(6):2937-45
8 Yao Y, Xie Y, Kim KS. Genomic comparison of E. coli K1 strains isolated from the cerebrospinal fluid of patients with meningitis. Infect & Immun, 2006; 74(4):2196-206
9 Yao Y, Vuong C, Kocianova S, Villaruz A, Lai Y, Sturdevant D, Otto M. Characterization of the Staphylococcus epidermidis accessory-gene regulator response: Quorum-sensing regulation of resistance to human innate host defense. J Infect Dis, 2006; 193(6):841-8
10 Yao Y, Sturdevant D, Villaru A, Xu L, Gao Q, Otto M. Factors characterizing Staphylococcus epidermidis invasiveness determined by comparative genomics. Infect & Immun, 2005; 73(3):1856-60
11 Yao Y, Sturdevant D, Otto M. Genome-wide analysis of gene expression in Staphylococcus epidermidis biofilms: insights into S. epidermidis biofilm pathophysiology. J Infect Dis, 2005; 191(2):289-98
12 Kocianova S, Vuong C, Yao Y, Carmody A, Otto M. Key role of poly-gamma-DL-glutamic acid in immune evasion and virulence of Staphylococcus epidermidis. J Clin Invest, 2005; 115(3):688-94
13 Vuong C, Kocianova S, Yao Y, Carmody AB, Otto M. Increased colonization of indwelling medical devices by quorum-sensing mutants of Staphylococcus epidermidis in vivo. J Infect Dis, 2004; 190(8):1498-505
14 Yao Y, Zhang WW, Jiao RS, Zhao GP, Jiang WH. Efficient isolation of total RNA from antibiotic-producing bacterium Amycolatopsis mediterranei U32. J Microbiol Meth, 2002; 51(2):191-5
代表性中文論文:
1 后抗生素時代的耐藥防控對策 姚玉峰 上海交通大學醫(yī)學院教授 文匯報 2015-01-18
2 細菌體內的蛋白質降解 優(yōu)先出版 李淑嫻; 姚玉峰 微生物學報 2014-12-30 16:12
3 后抗生素時代的耐藥防控對策 姚玉峰 世界科學 2014-12-15
4 A combined in silico strategy for screening surface-exposed proteins of Leptospira interrogans 曾令兵; 莊緒冉; 丁夏麗; 崔澤林; 王彥卓; 姚玉峰; 郭曉奎; 朱泳璋 中華醫(yī)學會2014全國微生物學與免疫學學術年會論文匯編 2014-08-20
5 乙酰化對鼠傷寒沙門菌酸耐受應答的影響 任潔; 桑昱; 姚玉峰; 趙明文 上海交通大學學報(醫(yī)學版) 2014-05-28
6 大腸埃希菌中λ-Red同源重組系統(tǒng)介導的trp和yfp基因融合表達的研究 陳興; 姚玉峰; 周愛萍; 倪進婧 上海交通大學學報(醫(yī)學版) 2012-11-28
7 結核分枝桿菌微進化研究與臨床應用 姚玉峰 上海交通大學學報(醫(yī)學版) 2012-11-28
8 結核分枝桿菌Mtub-39位點多態(tài)性與下游基因表達關系的研究 周愛萍; 徐志弘; 孫青; 姚玉峰; 吳興福 上海交通大學學報(醫(yī)學版) 2012-11-28
9 結核分枝桿菌致病機制及結核病新型診斷技術研究 姚玉峰; 張舒林 上海交通大學學報(醫(yī)學版) 2012-09-28
10 人附紅細胞體感染實驗診斷方法的建立 王劍飚; 樊綺詩; 倪麟; 倪培華; 姚玉峰 檢驗醫(yī)學 2011-11-30
11 Rv1272和Rv1273與結核分枝桿菌耐藥相關性研究 程旭紅; 孫青; 姚玉峰; 周愛萍; 趙英偉 上海交通大學學報(醫(yī)學版) 2011-07-28
12 大腸埃希菌Ⅵ型分泌系統(tǒng)相關蛋白多克隆抗體制備及分泌蛋白檢測 施瀟磊; 陳小溪; 金銳; 李浩; 薛佩; 姚玉峰; 陶晶 上海交通大學學報(醫(yī)學版) 2011-01-28
13 結核桿菌MazG的酶學性質和功能研究 呂亮東; 范小勇; 趙國屏; 姚玉峰 中華醫(yī)學會結核病學分會2010年學術年會論文匯編 2010-09-15
14 微生物與人類 姚玉峰 世界科學 2010-04-15
15 結核分枝桿菌H37有毒株與無毒株的代謝相關基因pabB和lpdA啟動子活性分析 孫青; 呂亮東; 姚玉峰; 趙英偉 微生物學報 2010-04-04
16 蛋白質組學在結核分枝桿菌研究中的應用 王一鳴; 陶晶; 郭曉奎; 姚玉峰 微生物學通報 2009-02-20
17 幽門螺桿菌逃避宿主免疫應答的機制 周妍; 姚玉峰; 郭曉奎 胃腸病學 2007-10-25
榮譽獎勵:
1. 獲中國科學院上海植物生理生態(tài)研究所優(yōu)秀畢業(yè)生獎。
2. 獲NIH訪問學者獎。
3. 獲美國微生物學會雜志優(yōu)秀論文獎。
4. 獲上海交通大學“晨星青年學者獎勵計劃”SMC優(yōu)秀青年教師獎。
5. 獲上海交通大學醫(yī)學院“新百人計劃”。
6. 2009年,獲上海高校東方學者稱號。
7. 2009年,獲上海市青年科技啟明星稱號。
8. 獲上海交通大學醫(yī)學院首屆“青年十杰”稱號。
鐘情微生物研究的“啟明星”
——訪上海交大醫(yī)學院東方學者特聘教授姚玉峰

2009年對35歲的姚玉峰是個好運年,這一年里他先后入選上海市科技啟明星計劃和獲聘上海市東方學者特聘教授 稍微了解內情的人知道,能獲此兩項殊榮相當不易,要在強手如林的上海交大醫(yī)學院(包括實力非常強的各大附屬醫(yī)院)拿到啟明星計劃,首先要在系統(tǒng)內的打擂臺巾勝出;而后者則要求申請者在國外有5年以上的學習、工作經歷,且已在相關學科研究領域建立起自己的研究團隊。
啟明星名錄上顯示姚玉峰從事的是微生物學研究,這更引起我的興趣,因為我近年來不時聽說國際生命科學界正對微生物研究抱有越來越濃厚的興趣,圍繞微生物基因組學有可能引發(fā)新一輪的生命科學研究熱潮。由此,筆者幾天前訪問了這位優(yōu)秀的年輕人,聽他講述他和微生物研究的故事。
因為喜歡微生物專業(yè)
姚玉峰70年代出生于安徽蚌埠,5歲隨從軍的父母到r東北嫩江并在那里瀆完了小學為了能讓他接受好一點的教育,他們舉家回到安徽老家整個中學期問,姚玉峰稱自己算是中規(guī)中矩的讀書,由于成績不錯考入位于蕪湖的安徽師大,專業(yè)為生物學 臨近畢業(yè)那年(95年)就業(yè)形勢不好,畢業(yè)生大都只能到縣中任教,而且當時的高考生物已經不是必考科目不理想的就業(yè)現(xiàn)實加上對科研有興趣,姚玉峰報考了南京農業(yè)大學的研究生部分原因是當時國內對微生物同氮研究正熱,而南京農大在這方面很有名氣。
讀研時,姚玉峰發(fā)覺南農大的分子生物學比較弱,加上讀了一年后他的導師到日本留學等原因,經人推薦,姚玉峰與分子生物學基礎和實驗條件相對較好的上海農科院食用菌研究所取得了聯(lián)系,于1996年來到上海農科院逗留了一年半。在此期問,他利用農科院的實驗設備完成了碩士論文課題 整個實驗基本上是小姚一個人獨自設計和操作。實驗完成后當時的農科院院長想留下他,但姚玉峰想繼續(xù)念博士,這樣在1998年小姚如愿考到中科院上海瞳物生理所談起考博,姚玉峰說當時其實也是很懸的:
“當年植生所微生物學專業(yè)只招2個博士生,而當時所里已有2位碩七畢業(yè)后留所工作的職工報考,通常情況下肯定是要優(yōu)先考慮他們的。一些原本準備報考的人聽說后都退出了,但我因為真正喜歡微生物這個專業(yè),上海這邊做微生物研究的不多,植生所對我吸引力挺大的 所以即使可能性較小,我也不想放棄。”放手一搏的最終結果是皆大歡喜,姚玉峰后來聽說,由于其考試成績突出,所里商量后決定調劑一個名額,而這樣的一個改變成了姚玉峰人生的一個轉折點。
姚玉峰所說的他人生的轉折點.在我了解了他的發(fā)展之路后我覺得他確實是在正確的時間、正確的地方做出了正確的選擇二當時人類基因組計劃已經醞釀有日,正緊鑼密鼓地在國際上布局推進,彼時已有學者提出,人類要真正解開生物世界諸多發(fā)育演化之謎,并進而造福于人類本身,除了人類本身和動植物世界外,在這個星球上分布更為廣泛、數量極為豐富、與人類關系密不可分的微生物世界的情況人類尚有太多的知識空白點。
得益于名師的指點
當時,有不少有識之士呼吁要實施微生物基因組計劃,而在中國,除了中科院微生物所和武漢病毒所等不多的幾個專業(yè)機構外,中科院上海植生所是在微生物基礎研究方面很有特色和積累的單位,這個所有同內微生物研究的代表性人物,如焦瑞身先生和趙國屏院士等,這些情況姚玉峰都非常清楚,所以當他知道自己被植生所錄取,而且導師就是趙國屏先生和焦瑞身先生時,他的高興是不難想見的。
1998年到了植生所后,經與導師討論,姚玉峰確定了抗生素代謝調控方向,并很快參與了當時實驗室力復霉素(一種抗結核菌藥物)的科研課題力復霉素是一種放線菌產生的,經分離純化后可用于臨床。姚玉峰說他正是從這個課題起真正進入了醫(yī)學相關的分子生物學領域。談起4年博士生活,姚玉峰說趙同屏老師對他的影響至深:
“趙老師當時帶了7-8個研究生,由于他身兼多個重要職務,所以每個月只有有限的幾天在所里,只要他一進實驗室,我們學生就排著隊找他。雖然見面時間有限,但我們感覺很有收獲趙老師對學科領域新的動向有很好的判斷、把握,而且擅長從大量文獻中抓到實質性的東兩,做開拓性的探索研究,如微生物基因組,他是國內的開創(chuàng)者之一。當時人們正熱衷于人類基岡組學,但他和一批學者已在大力倡導推動微生物基因組學{嘻如基因芯片技術在國際上剛開始推出不久,他很快就把這些技術引術進到我們的實驗室。
我和趙圍屏先生也比較相熟,曾多次采訪過他,在我看來趙先生確實是那種對科學研究有著一種發(fā)自內心喜歡的人,他對微生物的關注和對這一學科的貢獻我通過不同側面已有所聞。所以姚玉峰一說起這些我非常認同,同時也為姚玉峰能得到名家指點而高興。小姚告訴我,跟著趙老師幾年,他感到最佩服的是趙先生的學習能力。
“我從他那里學到最主要的東西是知道了什么是學習盡管我們都一直在學習,但實際上我們很多人并不會學習。其實學習不僅是看書、討論,也不僅是研究,而且更是一個人時時處處都能處于學習狀態(tài),特別是對新事物有強烈的學習愿望和領悟力創(chuàng)造性正是來自這種時時處處的學習,來自對別人經驗的體會和借鑒,在這些方面趙老師都是我們的榜樣,他一直在學習新東西,當時人類基因組很熱門,借助基因測序平臺,他在2002年就有一篇鉤端螺旋體(一種致病菌)基因組的文章投稿并發(fā)表在英國《自然》雜志上”
出國深造助其寬視野
攻讀完植生所的博士。學位后,姚玉峰的起點和視野都有提升,他選擇了進一步去美國深造 2002年他去了美同國立健康研究院(NIH)過敏與傳染病研究所(Nl-AID)做博士后研究。在NIH的2年期間,他在語言和科研方而都有很大的進步,由于研究經費充足加之工作努力,他在那里發(fā)了7篇文章。2年后,姚玉峰又轉到約翰•霍普金斯大學醫(yī)學院,在這個世界著名的醫(yī)學研究機構,除了拓展到新的傳染病研究領域外,他還學到r實驗室運轉管理的經驗而這些實際經驗對他日后回國開展獨立實驗室研究很有幫助。
姚玉峰說他很幸運,在他科研生涯的起步階段得到了國內外最好的三個機構的不同側面的訓練,沒有浪費一點時間。
2006年,姚玉峰開始聯(lián)系回國,岡為他的方向已轉向醫(yī)學微生物學,所以把聯(lián)系方向轉向醫(yī)學院,這樣在2007年中就到了上海交大醫(yī)學院(原上海第二醫(yī)學院)一開始的耶段時間對姚玉峰也是一個考驗,校方當然是很支持他,給了他兩間大的教室,并給了他一些啟動資金,于是他從土建開始建實驗竄,接著是購買儀器沒備等:姚玉峰說得益于教研室主任郭曉奎教授的支持,自己進入狀態(tài)很快,2007年6月回國,當年底實驗室裝修完成,2008年他就拿到國家自然科學基金面上項日,同年又獲得了科技部“973”計劃支持,2009年拿到啟明星項目。
日前,姚玉峰的病原細菌學實驗室主要研究方向是病原細菌基因組學及致病機制研究具體研究與新生兒腦膜炎相關的大腸桿菌和引起肺結核的結核分枝桿菌兩種病原大腸桿菌的研究是姚玉峰在約翰•霍普金斯大學醫(yī)學院工作的繼續(xù),在此領域姚玉峰有著扎實的基礎,并且至今仍同原來的實驗室保持良好的合作關系。
院方的統(tǒng)計材料顯示,姚玉峰近五年內共發(fā)表SCI研究論文16篇。其中一篇作為第一作者發(fā)表在《Infetion&Immunity》(2006)的論文被評為美國微生物學會雜志優(yōu)秀論文,美國同微生物學會官方雜志《Microbe》專門發(fā)表了評述。但姚玉峰覺得這些數據只能說明他的過去,“今后幾年里,我們實驗室會陸續(xù)發(fā)表一批引起國內外同行關注的文章”,姚玉峰在帶我參觀他的實驗室時這樣介紹,言語間透出自信以及對未來的期待。
來源:世界科學 2010年第4期
[學者筆談]姚玉峰:我的“青椒”生涯
[編者按] 繼2011年上半年推出“身邊的感動”系列報道受到廣泛好評后,從2011年10月起,我們推出了新欄目“學者筆談”。本欄目將陸續(xù)推出一批我校有影響的學者,重點展示他們在人才培養(yǎng)、科學研究、服務社會和文化傳承與創(chuàng)新等方面的觀點和見解、思路和做法及理論和實踐,旨在弘揚科學精神,激蕩人文情懷,回歸學術本位,濃郁學術氣象,全面提升交大學術的影響力和傳播力。
■ “和諧實驗室”主要目的是給研究生和老師營造一個具有和諧融洽氣氛的實驗室,在這里每個學生不僅學會如何做科研,更要學會如何做事,如何做人,我想這對他們將是受益終生的。
■ 人生已走過近40個春秋,也有著各種各樣痛苦和快樂的經歷,其中最深刻的感受是:一是教研結合;二是準確定位;三是張弛有道。
■ “青椒”們要懂得“文武之道,一張一弛”。在不需要你拼命的時候要懂得珍惜身體,合理作息,給自己和家人一個健康身體,但是在需要你拼命的時候請一定要懂得堅持與拼搏。
■ 抓住每一個機會,不斷地發(fā)展自己,也造就了你自己的人生,因為在我看來,人生就是一個又一個目標的接力。
接到編輯部的約稿,正感覺自己要寫點什么。不知不覺已近不惑之年,想給自己寫點東西,雖然很早就想寫這些年來的感受,但真的要寫的時候卻又不知道該怎么下筆了。年紀大了,就會經常回想起過去的點點滴滴,現(xiàn)在想來年少的生活很簡單,年少的思想也很簡單,一切都是按部就班的進行,感覺是隨波逐流,好像從來沒有思考過自己的未來,至少沒有真正的思考過。有個笑話,說是很多有錢人早上不想起床,不是太累想睡一會懶覺,而是生活沒了目標,不知道起床以后干什么。當然在高校中這種情況較罕見,不論是學生還是教師大家都在忙碌著,或迫于尊嚴、或迫于生計、或迫于壓力,當中也有很多人樂于自己的興趣,按照既定的目標前行。我也在經歷各種人間凡事后從懵懂少年成為一名老師,期間很多人生的關鍵點大多能實現(xiàn)自己的目標。幾天前開會期間和我的博士導師閑聊時發(fā)覺今年是博士畢業(yè)的10周年,而來交大轉眼也已5年。古人說“三十而立,四十不惑”,正是該借此機會對自己走過的路好好回顧一下的時候。
懵懂進入師范學堂
70后的我出生于普通的工人家庭,在農村度過學前時光。父親曾是軍人,對我要求較嚴,特別是學習方面。我在東北讀完小學,接著在當地中學繼續(xù)讀書,本來我覺得東北挺好的,還有很多好朋友,但父親覺得東北的教育水平還是不如安徽,而且有故土情結,想回家,所以我也就隨著父母回到了家鄉(xiāng)繼續(xù)讀書。初中階段我是跟隨著自己的興趣玩了三年,到了高二才感覺到高考的壓力,理科7門課,門門重要。當時有句名言“7減1等于0”,也就是說有一門課成績不好,高考就沒戲,因為當時的高考錄取率是1/8到1/7,文科達到1/10,正所謂“千軍萬馬過獨木橋”。好在后來自己很努力,高考成績還不錯。填報志愿時我根本不知道自己將來要做什么,我初中的語文老師金秋莎是個很好的老師,不僅課教的好,而且對學生很熱心。她建議我填報安徽師范大學,這樣錄取的機會很大,而且將來畢業(yè)后當一名老師,在當時看來也是個不錯的職業(yè)。接下來選什么專業(yè)是個大問題,我的數物化成績不錯,但當時高考對生物愈來愈重視,所以打算學生物專業(yè),圖的是將來畢業(yè)后能有較好的選擇。于是我就帶著畢業(yè)后到中學教生物的打算上了大學。
輾轉走上科研道路
1991年開始了大學生涯,然而沒兩年,原有的人生規(guī)劃被打亂,原因是高考的改革。在新的高考政策里,生物學已經風光不再,語數外的地位凸顯。班里的很多同學也都在考慮將來的前途,一些人打算畢業(yè)后轉行,更多人在準備考研,我也決定去讀研,現(xiàn)在看來這個決策非常明智。在選擇報考專業(yè)時,我仔細考慮了很久。通過課堂和課外閱讀,我發(fā)現(xiàn)微生物很有意思,首先是種類繁多,而且這么小的一種生物,竟然有非常大的能量。微生物參與地球各種物質循環(huán),是生物進化過程中至關重要的一環(huán),很多基礎的生物學問題,如物質和能量代謝、遺傳和變異、細胞分裂等都是以微生物作為模型來研究并得到解決。此外,微生物能凈化污水,能發(fā)酵釀酒,也能給人類健康帶來嚴重威脅和巨大益處。加之當時鄰近蕪湖的南京農業(yè)大學的微生物專業(yè)在國內很有地位,所以就報考了南京農業(yè)大學的環(huán)境微生物學方向。
1995年來到南京,一年后基礎課剛上完,導師就出國了,而且是長期的。導師走之前和我討論了將來的課題,我當時希望能分離純化一種降解廢水中染料的關鍵酶。但實驗室當時的條件無法滿足我的課題需要,無助的我只好自己聯(lián)系了上海農業(yè)科學院,得到了時任院長潘迎捷教授的支持,接下來的近二年的時間里,我在上海農科院食用菌研究所進行碩士論文研究工作。在食用菌研究所,雖然老師們非常支持,但關于我的課題他們卻無法提供實質的幫助,畢竟他們都在做食用菌的應用和基礎研究,而不是染料降解。“自己動手,豐衣足食”,經過自己的努力,順利的完成了碩士論文。在碩士二年級時,我就在考慮將來的發(fā)展,基于我的表現(xiàn),食用菌研究所非常希望我畢業(yè)后留下來工作,或者是考潘迎捷老師的博士。而我當時覺得食用菌固然重要,但能做一些與人類健康相關的研究則更有意義。所以當時就報考了中科院上海植物生理研究所的博士研究生,研究方向是抗結核藥物力福霉素的研究,這也與我現(xiàn)在的結核分枝桿菌的研究有聯(lián)系。
1998年又回到上海,開始了我的博士研究生的學習,在導師焦瑞身先生和趙國屏教授的指導下進行放線菌產力福霉素的研究。焦先生年事已高,趙老師當時身兼數職,非常忙碌,每學期很難見到幾次,課題都是在師兄師姐們的幫助下進行的。當時實驗室流傳一句話“趙老師的學生獨立性都很強”,很好的描述了我們當時的境況。不過對于我,由于有了碩士階段的經歷,眼前的現(xiàn)狀都算是“浮云”。雖然和趙老師見面的機會不多,但每次和他討論課題都收獲很大。趙老師以科研為生命,不斷學習的執(zhí)著態(tài)度強烈著感染著實驗室每一個人,而且在趙老師的實驗室耳濡目染都能學到很多。Kahlil Gibran的“從工作里愛了生命,就是通徹生命最深的秘密”可謂是對趙老師最真實的寫照。2003年SARS肆虐的時候,趙老師沖在第一線,組織國內各相關機構在基因組水平對SARS進行流行病學分析,對SARS進化研究做出了突出的貢獻,獲得了國內和國際的公認。特別有感觸的是趙老師對學科領域新的動向有很好的判斷和把握,喜歡做開拓性研究,如微生物基因組,他是國內的開創(chuàng)者之一。又如最近兩年細菌蛋白質乙酰化修飾的開創(chuàng)性工作,得到了國內外的廣泛認可。在趙老師的指導下,經過四年的努力和實驗室老師同學,特別是姜衛(wèi)紅老師的幫助,終于順利通過畢業(yè)答辯,并于同年獲得博士學位證書。畢業(yè)后我先后去了美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)和約翰霍普金斯大學醫(yī)學院進行了五年的博士后研究。博士畢業(yè)前,我已打算今后能從事微生物相關的科學研究,并希望將來的研究能更進一步的與人類健康接軌,所以博士后的單位都是做病原菌研究的。
2002年坐上人生第一次飛機到了美國,NIH的研究條件非常好,在那里我學習了很多先進的技術,如基因芯片和共聚焦顯微鏡等,英語的口語和寫作能力得到了較大提高,文章發(fā)表數量和質量都不錯。但當時的實驗室風格是PI(課題組長)確定具體課題,博士后沒有選擇余地,這對我將來回國,建立獨立實驗室的計劃沒有太多的幫助。兩年后我轉到約翰霍普金斯大學醫(yī)學院繼續(xù)進行博士后工作,在這里除了拓展到新的傳染病研究領域外,還學到了課題立項、申請、實施以及實驗室運轉管理的經驗。而這些經驗對我以后回國獨立開展研究工作很有幫助。可以說在科研生涯的起步階段得到了國內外最好的三個機構的不同方面的訓練,為日后順利開展科研工作做了很好的鋪墊。
再度拿起執(zhí)教之鞭
5年的博士后研究很快過去了,打算著回國發(fā)展。原來從研究所畢業(yè)的,比較了解研究所的氛圍,不是很喜歡,還是覺得大學的氣氛較好,除了科研,還可以做些教學。由于一些機緣巧合,我來到了上海交通大學醫(yī)學院,開始了我的“青椒”生涯。一開始的那段時間,雖然學校和教研室很支持,給了兩間實驗室和一些啟動資金,但對我仍是一個考驗。如何設計實驗室、怎樣用捉襟見肘的經費購買必要設備、搭建各種實驗技術平臺等。好在通過自己和實驗室成員的努力以及各方面的支持,實驗室在經過近五年的運轉后,已經處于一個比較好的狀態(tài),包括人員組成、科研經費、平臺技術以及科研產出等方面。特別是我構建“和諧實驗室”的理念得到了很好的實施。“和諧實驗室”主要目的是給研究生和老師營造一個具有和諧融洽氣氛的實驗室,在這里每個學生不僅學會如何做科研,更要學會如何做事,如何做人,我想這對他們將是受益終生的。在交大的5年里,得到了學校很多老師的支持和幫助,特別是教研室主任郭曉奎教授的悉心指導。他的很多經驗成為我解決問題的法寶,使我能更快地進入狀態(tài)和更好地開展工作。和已經比較得心應手的科研工作相比,我又面臨新的挑戰(zhàn)-教書育人。因為來到高校,意味著不僅要做一名科學家,同時也要做一名教師,而且兩手都要抓,兩手都要硬。現(xiàn)在仍然清楚的記得剛開始備課時的緊張和痛苦,花了很多時間來看教材以及大量的相關資料,同時旁聽老教師的課,或者看他們上課的錄像。教學工作從一開始的自己緊張和學生反應平淡到現(xiàn)在課堂上自信自如和連續(xù)幾年學生評價高于教研室和基礎醫(yī)學院的平均水平。
人生已走過近40春秋,也有著各種各樣痛苦和快樂的經歷,對于自己以及與自己類似的“青椒”群體多多少少有些感想,這里就簡單談談。
一是教研結合。作為高校的教師,現(xiàn)在的評價制度已大不同前,不只是教好書,更要做好科研。很多人將教學與科研視為矛盾體,覺得教好書的搞不好科研,科研做的好的教不好書。當然,有的老師每年三四百學時,每天都有課,基本很難抽出時間從事科研。課題很多的老師則不可能上很多課,否則課題任務完不成,因為每個人的時間總是有限的。美國在這一點做的比較好,比如一個約翰霍普金斯醫(yī)院的醫(yī)生,他既從事臨床工作,也有科研任務,他的工資表就清楚的表明臨床工作(clinical effort)和科研任務(research effort)占的百分比,他的收入也就由臨床工作和科研任務共同決定。我們國家高校的體制還存在很多問題,目前是以科研為主導的氣候,對教學有些忽視。但作為高校“青椒”,我覺得科研和教學不是矛盾,而是相輔相成的不可缺一的Complex(復合體)。首先現(xiàn)在高校的教學已經不再是照本宣科,用著幾年或十幾年不變的講義來填鴨。雖然教材的基本內容不可能有徹底的改變,但實質的內容已經在不停更新和豐富,其源泉就是最新的科研成果。其次在教學過程中可以發(fā)現(xiàn)很多有意義的問題,這些問題可以通過科研在實驗室中來探索解決。在這方面,我有深刻的體會。我實驗室主要研究做結核分枝桿菌以及腸道桿菌,在這方面的經驗較多,每當給學生講述這方面的內容時,感覺特別自如,將具體內容與臨床相結合,同時引入最新的研究進展,將枯燥的書本內容講的很吸引人,這樣課堂效果也好,學生也有興趣。
二是定位準確。有了對高校教學和科研關系的正確認識,每個“青椒”還要對自己有合理準確的定位,也就是說自己的effort到底有多少用在教學上,有多少effort用在科研上。雖然目前各大高校的評價體系偏向于科研,算經費和加SCI論文影響因子,但我覺得將來定會采用更合理的評價指標和體系。比如中國科學院系統(tǒng)將雜志按照在各學科的影響力綜合進行分區(qū),而不是機械按影響因子排序。現(xiàn)階段每個人都可根據自身條件和狀況來給自己一個定位,是做一個偏教學的教師,還是做一個偏科研的教師,還是一個雙管齊下的全才。偏重教學的教師能否在教學過程中進行教學形式的創(chuàng)新,能否參照新近科研進展進行教學內容的調整,能否提出一些待解決的重大問題,讓學生思考。偏重科研的教師能否在科研過程中避免過分專注某一小領域,造成只見樹木,不見森林的狀況,能否考慮并嘗試解決教學過程中發(fā)現(xiàn)的科學問題。這里提一下基礎醫(yī)學院的Co-PI政策,該政策目的是對有學術發(fā)展?jié)摿Φ?ldquo;青椒”給予一定的待遇和支持,特別是要求他們在固定PI的指導下工作,目標是3到5年后成長為獨立PI。這個政策給了本土青年教師,特別是定位于科研的“青椒”們一個非常好的機會,可以通過此途徑得到鍛煉和成長。
三是張弛有道。當然,現(xiàn)代社會各個行業(yè)競爭都十分激烈,高校也不例外。眾所周知,高校“青椒”壓力山大,教學壓力、課題壓力、文章壓力、晉升壓力、經濟壓力等等都是“青椒”身上的大山,使得“青椒”疲憊不堪。但我認為越是在這種情況下,“青椒”們越要懂得“文武之道,一張一弛”。在不需要你拼命的時候懂得珍惜身體,合理作息,給自己和家人一個健康身體,但是在需要你拼命的時候請一定不要對自己手下留情。現(xiàn)在很多高校也意識到這個問題的嚴重性,通過各種活動為“青椒”減壓,比如我們基礎醫(yī)學院舉辦的各種體育活動班就是很好的例子,充分給大家提供鍛煉身體,緩解壓力,增進交流的機會。“青椒”也應充分利用這些機會,為自己創(chuàng)造一個良好的工作和學習的氛圍。
現(xiàn)在回頭去看看我這近40年的經歷,很多感嘆,也有很多遺憾。感嘆的是在自己能為自己的將來人生作出規(guī)劃后,都能設定較好的短期的或是長期的目標,并努力達到。遺憾的是在很多時候,我也曾沒有把握住機會。有人說,命運給每個人的機會都是均等的,當機會出現(xiàn)時,每個人都應該努力去抓住,因為失去了便沒有下一次。抓住每一個機會,不斷的發(fā)展自己,也造就了你自己的人生,因為在我看來,人生就是一個又一個目標的接力。從小到大,從年輕到成熟,人生的每一個階段都應該有目標,否則就沒有了生活的動力,畢竟我們要為了尊嚴、為了生計、為了理想活著。所以,要么做個有錢人,要么做個有人生目標的人。一點感悟,與“青椒”共勉。時值博士畢業(yè)10周年,也是趙國屏老師回國20周年,謹以此文感謝趙老師知遇之恩。
學者小傳
姚玉峰,博士,上海交通大學醫(yī)學院博士生導師,上海交通大學醫(yī)學科學研究院病原細菌學實驗室課題組長,上海高校特聘教授,中國微生物學會分析微生物專業(yè)委員會委員,上海市微生物學會醫(yī)學微生物專業(yè)委員會委員。
2002年于中科院上海生命科學院獲博士學位,2002年至2007年分別在美國國立衛(wèi)生研究院和約翰霍普金斯大學醫(yī)學院從事博士后研究。2007年作為引進人才進入上海交通大學醫(yī)學院工作。
目前主要從事結核分枝桿菌致病機制、基因組微進化和腸桿菌分泌系統(tǒng)研究,并獲得了科技部國家重點基礎研究發(fā)展計劃、科技部傳染病重大專項、國家自然科學基金委和上海市科委、教委的資助。曾獲上海高校東方學者、上海市青年科技啟明星、上海交通大學晨星青年學者獎勵計劃SMC優(yōu)秀青年教師、上海交通大學醫(yī)學院“新百人計劃”、上海市青年科技啟明星(跟蹤)、上海交通大學醫(yī)學院首屆“青年十杰”等榮譽稱號。
在J Biol Chem、J Infect Dis、Infect & Immun、Science等國際知名SCI期刊上發(fā)表研究論文近30篇,論文多次被Nat Rev Microbiol、Annu Rev Genet和Curr Opin Microbiol等高水平綜述雜志引用,并擁有多項國際和國家專利。多次受邀參加國內和國際學術會議并做大會報告。
主持醫(yī)學院本科生《醫(yī)學微生物學》以及研究生的《細胞微生物學》等課程建設,以及參與“探究為基礎的學習”(RBL)教學改革工作,指導醫(yī)學本科生進行科研訓練,并獲得一項上海市大學生創(chuàng)新性實驗計劃。此外,長期作為咨詢專家參與上海市青少年科技活動,負責指導中小學生進行課外科研活動。
來源:上海交通大學 2012-12-02