專家信息：

張延，女，1963年8月出生，漢族。上海交通大學系統生物醫學研究院研究員，系統生物醫學研究院糖生物學和糖組學實驗室課題組長，博士生導師，SCSB-AIST中日醫學糖組學聯合實驗室中方主任，2007年上海市浦江人才。

教育及工作經歷：

1982-1986， 山東大學微生物學專業 本科。

1991-1993， 日本東京大學應用生物工程專業 碩士研究生。

1993-1996， 日本東京大學應用生物工程專業 博士研究生。

1986-1989， 上海交通大學生物與技術系 助教。

1996-2001， 日本產業技術綜合研究所，分子生物學研究部 博士后。

2001-2004， 日本產業技術綜合研究所醫學糖科學研究中心 助理研究員。

2004-2006， 日本國立動物衛生研究所免疫研究部 特別研究員。 

2006-至今，上海交通大學系統生物醫學研究院 研究員、課題組長，兼任中日醫學糖組學聯合實驗室 中方主任。

學術兼職及社會任職：

1. 中國生物化學與分子生物學會第五屆復合糖專業委員會 常務委員（2010.08-2014.08）。

2. 中國生物工程學會第二屆糖生物工程專業委員會 常務委員（2012.03-）。

3. 中國生物化學與分子生物學會第三屆蛋白質組學專業委員會 委員（2011.04-2015.04）。

4. 亞洲糖生物學組織聯盟(ACGG) 成員。

5. 江南大學 客座教授；江南大學糖化學與生物學技術教育部重點實驗室 學術委員。

主講課程： 

資料更新中……

培養研究生情況：

出站博士后1人，博士生4人，碩士生2人

在讀博士生5人，在讀碩士生4人

研究方向：

1. 腫瘤功能糖生物學 ：（糖基轉移酶功能 、蛋白質O-GalNAc糖基化調控機制、糖鏈在腫瘤細胞中的變化規律和調控機制）

腫瘤細胞的異常糖基化現象早已被報道，目前對這一現象所涉及的機理和造成的影響卻仍然所知甚少。糖基轉移酶是腫瘤細胞表面O-糖基化的基礎，它決定著腫瘤細胞表面糖蛋白O-糖基化的數量和結構種類。本實驗室從糖基轉移酶著手，致力于闡明糖基化這一重要翻譯后修飾與癌癥的關系。

我們研究發現了一種新的定位于內質網的蛋白質O-糖基化調控關鍵酶多肽N-乙酰氨基半乳糖基轉移酶（ppGalNAc-T18），該酶只存在于脊椎動物，雖不具有經典的糖基化活性，但是可以選擇性地促進同家族其他酶的糖基化活性，影響細胞表面蛋白的糖基化及細胞生長。該研究對教科書上關于蛋白質的O-GalNAc糖基化過程只發生在高爾基體中這一傳統觀念提出挑戰，首次提出了內質網中可能存在新的蛋白質O-GalNAc糖基化調控機制。該成果發表在國際糖生物學研究領域權威雜志Glycobiology上（Glycobiology 2012, 22(5): 602-615）。

圖1. (A) Veterbrate-specific T18 localized in ER rather than Golgi. (B) T18 lacks catalytic activity, but can selectively enhance the activity of other ppGalNAc-Ts. (C) Knockdown of T18 inhibited the cell growth, changed the cell morphology, and altered the cell O-glycosylation level. 

2. 疾病蛋白質組學和糖組學 （臨床血清蛋白質組學和代謝組學 、蛋白質糖基化修飾系統生物學研究）

隨著分析技術的不斷發展，蛋白質組學、代謝組學及糖組學研究為人類進行疾病的診斷防治和新藥開發提供重要的理論基礎。同時，研究疾病特異性蛋白質的翻譯后修飾，為疾病提供了新的治療方案。這些組學研究已經在醫學領域中顯示出其廣泛的應用前景，而且其技術及應用還在不斷突破中。

1）臨床血清蛋白質組學研究

運用相對定量血清蛋白質組學和分子生物學研究技術，我們系統性地解析了不同分期結直腸癌病人血清、組織樣本中細胞外基質組分--I型膠原蛋白在結直腸癌發生發展中的生物學行為。首次發現腫瘤病人血清中I型膠原蛋白的代謝性降解產物羧基末端肽（CTx）的含量與結直腸癌病人的分期呈正相關，血清中CTx的變化與病人的預后生存期相關。表明血清中CTx標志物檢測對結直腸癌預后的臨床診斷具有參考意義。研究提示伴隨腫瘤生長所產生的代謝性特異降解多肽片段，是未來血清腫瘤生物標志物發現的重要目標候選分子群。研究同時為血清蛋白組學手段在臨床檢測上的應用提供了功能組織學佐證。該成果發表在歐洲蛋白質組學協會的Jounal of Proteomics雜志上(Jounal of Proteomics,2013,94:473-485)。

 

圖2. Up-regulation of type I collagen during tumorigenesis of colorectal cancer revealed by quantitative proteomic analysis 

2）臨床代謝組學研究

基于代謝組學技術平臺，我們共鑒定出249種人體血清代謝物，并建立了具有良好預測能力的結直腸癌病人與健康對照者的判別模型。基于統計分析，我們最終篩選出6種與結直腸癌密切相關的具有代表性的候補代謝標志物，建立了具有臨床應用探索價值的診斷模型。本研究中，我們系統地觀察到了結直腸癌病人體內代謝紊亂的現象。并首次比較全面地從血清代謝譜上觀察到結直腸癌病人體內異常加劇的脂肪酸合成與脂肪酸氧化代謝，該結果是對目前關于癌癥有氧糖酵解（Warburg effect）現象的又一種重要補充。另外，我們還發現了具有結直腸癌特異性的腸道菌群代謝異常現象。這些結果將有助于揭示結直腸癌發病的分子機制，為結直腸癌的早期診斷、療效評價、新藥開發、及合理飲食提供重要參考依據。本研究的相關成果發表在Journal of Proteome Research雜志上（JPR 2012,11(2): 1354-1363; JPR 2013,12(6): 3000-3009）。

3）蛋白質糖基化修飾系統生物學研究

O-GalNAc糖基化的起始步驟由ppGalNAc-T家族催化完成。ppGalNAc-T家族在人體中有20個成員，其中15個具有催化活性。ppGalNAc-T家族成員具有不同的組織分布和底物特異性，共同對蛋白質O-糖基化進行調控。目前已經發現的O-糖蛋白還很少，為了發現更多O-糖蛋白，理解ppGalNAc-T和底物之間的作用關系，我們開發了一種高通量篩選ppGalNAc-T底物的方法。這種方法結合了蛋白質組芯片的高通量篩選能力和click反應的高特異性，使用ppGalNAc-T天然底物的類似物UDP-GalNAz作為供體底物，在芯片上進行糖基化反應后，使用炔基熒光探針來檢測被糖基化的蛋白。我們用該方法對ppGalNAc-T2的底物進行篩選，得到了226個候選底物。這些候選底物中膜相關蛋白高度富集，但是也包括一些胞漿和核定位蛋白。我們對底物集中的p53和酪氨酸激酶相關通路中選擇的候選底物在體外全部得到了驗證。我們還通過質譜鑒定了p53的體外糖基化位點，并在細胞內發現p53確實有O-GaNAc糖基化修飾，但是其具體功能還有待進一步研究。這一方法也可以用于其它ppGalNAc-T成員的大規模底物篩選，得到ppGalNAc-T與底物的相互作用網絡，幫助我們理解ppGalNAc-T家族的重要作用。

圖4. (A) Enzymatic reactions are performed ‘on-chip’ by ppGalNAc-T2 using UDP-GalNAz (left track) or UDP-GalNAc (right track) as donor substrate. After click chemistry reaction, GalNAz-modified proteins conjugated by alkyne-fluorophore are then detected by a fluorescence slide reader. (B) 226 proteins were identified as substrate candidates of ppGalNAc-T2. (C) 17 selected proteins from p53 network and Tyrosine kinase network were validated by HPA lectin blot in vitro. (D) The O-glycosylation site on p53 was identified by Mass Spectrometry.

針對目前糖生物學研究中存在的高效特異性富集糖蛋白的技術難題，我們在利用磁性納米材料的基礎上，結合生物正交性標記和點擊化學等方法，開發了具有選擇性富集疊氮標記O-糖基化多肽及蛋白的炔基修飾納米磁珠，建立了從復雜生物樣品中分離富集糖基化蛋白的新方法，并成功應用于糖肽的質譜分析。該富集方法具有高效性和良好的特異性，有望為基于代謝標記的細胞動態糖基化研究提供一種方便有效的手段，也為化學和生物學交叉領域研究提供了新思路。該成果發表在英國皇家化學會的ChemComm雜志上（Chem. Commun., 2012,48:5907-5909）。

圖 5. Capture and release of azido glycopeptides with DA-MSPs. 

3、基于糖鏈生物標志物的疾病早期診斷技術

糖鏈參與細胞識別、細胞分化、發育、信號轉導、免疫應答等各種重要的生命活動。大量研究表明，腫瘤細胞的異常糖基化與腫瘤的發生發展密切相關。糖鏈有望成為診斷和治療腫瘤等復雜性疾病的重要靶點。我們利用凝集素富集糖蛋白技術，質譜鑒定糖蛋白糖基化位點、糖鏈結構的技術，比較不同發展時期差異糖蛋白譜及糖鏈譜，并通過生物信息學分析篩選與疾病發生發展相關的標志糖蛋白及糖鏈結構，結合體內外分子生物學驗證，將其應用臨床大規模血清檢測，實現對疾病的早期診斷。

承擔科研項目情況：

先后主持和承擔了國家973一級子課題項目2項，參與863項目1項，主持國家自然科學基金面上項目4項，國家和上海市科技合作專項項目2項。 

1. ppGalNAc-T在肺癌中的功能研究，2007-03-31。 

2. P19細胞神經分化相關ppGalNAc-T13的功能解析，2009-03-20。 

3. 疾病相關的糖組學研究，2010-03-29。 

科研成果：

1. 在世界上最早揭示了微生物咔唑代謝途徑；系統揭示了10種新的O-糖基轉移酶基因功能。已發表以Science，PNAS，JBC為代表的學術論文40篇， 申請國內外專利6項。 

2. 研究發現了一種新的定位于內質網的蛋白質O-糖基化調控關鍵酶多肽N-乙酰氨基半乳糖基轉移酶（ppGalNAc-T18 ） 。該酶只存在脊椎動物，雖不具有經典的糖基化活性，但是可以選擇性促進同家族其他酶的糖基化活性，影響細胞表面蛋白的糖基化及細胞生長。該研究對教科書上關于蛋白質的O-GalNAc糖基化過程只發生在高爾基體中這一傳統概念提出挑戰，首次提出了內質網中可能存在新的蛋白質O-GalNAc糖基化調控機制，該成果發表在國際糖生物學研究領域權威雜志《Glycobiogy》上。

3. 針對目前生物學研究中存在的高效特意性富集糖蛋白的技術難題，結合生物正交性標記和點擊化學等方法，合成開發了具有選擇性富集疊氮標記O-糖基化多肽及蛋白的炔基修飾的新型納米磁珠，建立了一種從復雜生物樣品中分離富集糖基化蛋白的新方法 ， 并成功應用于糖膚的質譜分析 。該富集方法為基于代謝標記的細胞動態糖基化研究提供了一種方便有效的手段。該成果發表在英國皇家化學會所屬的《ChemComm》 雜志。

4. 與日本產業技術綜合研究所醫學糖科學研究中心共建了中日醫學糖組學聯合實驗室 ， 與上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院的共同合作 ，綜合高通量凝集素芯片技術和快速臨床免疫分析技術，初步完成了 《肝纖維化糖鏈生物標志物的開發和驗證》中日合作項目，該技術為復雜疾病的微量血清糖鏈生物標志物的早期診斷技術開發奠定了基礎。

發明專利：

申請國內外發明專利6項，獲授權日本專利1項和中國發明專利3項。

1 ppGalNAc-T18特異性多克隆抗體的制備方法 張延;邵棟  【中國專利】 2008-10-30 2009-03-18 

2 CTx在制備診斷結直腸癌藥物中的用途 鄒霞;張延;楊芳;馮波;鄭民華  【中國專利】 2013-10-12 2014-01-22

3 一種針對ppGalNAc-T13多克隆抗體的特異性抗原肽及其制備與應用 張延;龐文杰  【中國專利】 2011-08-17 2011-12-28 

4 富集疊氮標記生物大分子的磁性納米材料及其制備與應用 張延;王勝;謝文嫻 【中國專利】2011-08-17 2012-04-11

5 ppGalNAc-T20抗原及其多克隆抗體的制備方法 張延; 彭燦; 武功冬; 鄒霞; 謝文嫻 【中國專利】 2010-01-07 2010-09-01 

 

現已發表以Science，PNAS，JBC為代表的學術論文40篇（其中有23篇文章為2006年回國后發表）。 

代表性英文論文：

1. Zou, X., Chi, X., Pan, Y., Du, D., Sun, H., Matsuda, A., Li, W., Kuno, A., Zhang, X., Narimatsu, H., Niu, J., and Zhang, Y*. (2014)."LecT-Hepa facilitates estimating treatment outcome during interferon therapy in chronic hepatitis C patients." Clin Proteomics, 11(1): 44.

2. Yu, D. M., Li, X. H., Mom, V., Lu, Z. H., Liao, X. W., Han, Y., Pichoud, C., Gong, Q. M., Zhang, D. H., Zhang, Y., Deny, P., Zoulim, F., and Zhang, X. X. (2014)."N-glycosylation mutations within hepatitis B virus surface major hydrophilic region contribute mostly to immune escape." J Hepatol, 60(3): 515-22.

3. Tan, B., Matsuda, A., Zhang, Y., Kuno, A., and Narimatsu, H. (2014)."Multilectin-assisted fractionation for improved single-dot tissue glycome profiling in clinical glycoproteomics." Mol Biosyst, 10(2): 201-5.

4. Shen, H., Zhang, X., Zhang, L., and Zhang, Y*. (2014)."Searching O-Glycoproteins with Metabolic Labeling and Two Dimensional Electrophoresis." Life Sci Res, 18(5): 377-381.

5. Zou, X., Feng, B., Dong, T., Yan, G., Tan, B., Shen, H., Huang, A., Zhang, X., Zhang, M., Yang, P., Zheng, M., and Zhang, Y*. (2013)."Up-regulation of type I collagen during tumorigenesis of colorectal cancer revealed by quantitative proteomic analysis." J Proteomics, 94: 473-85.

6. Zhu, X., Gong, Q., Yu, D., Zhang, D., Gu, L., Han, Y., Chen, J., Zhang, Y., and Zhang, X. (2013)."Early serum hepatitis B virus large surface protein level: a stronger predictor of virological response to peginterferon alfa-2a than that to entecavir in HBeAg-positive patients with chronic hepatitis B." J Clin Virol, 57(4): 318-22.

7. Zhang, X. and Zhang, Y*. (2013)."Applications of azide-based bioorthogonal click chemistry in glycobiology." Molecules, 18(6): 7145-59.

8. Tan, B., Qiu, Y., Zou, X., Chen, T., Xie, G., Cheng, Y., Dong, T., Zhao, L., Feng, B., Hu, X., Xu, L. X., Zhao, A., Zhang, M., Cai, G., Cai, S., Zhou, Z., Zheng, M., Zhang, Y. *, and Jia, W. (2013)."Metabonomics identifies serum metabolite markers of colorectal cancer." J Proteome Res, 12(6): 3000-9.

9. Aoki-Kinoshita, K., Sawaki, H., An, H., Campbell, M., Cao, Q., Cummings, R., Hsu, D., Kato, M., Kawasaki, T., Khoo, K., Kim, J., Kolarich, D., Li, X., Liu, M., Matsubara, M., Okuda, S., Packer, N., Ranzinger, R., Shen, H., Shikanai, T., Shinmachi, D., Toukach, P., Yamada, I., Yamaguchi, Y., Yang, P., Ying, W., Yoo, J., Zhang, Y., Zhang, Y., and Narimatsu, H. (2013)."The Fifth ACGG-DB Meeting Report: Towards an International Glycan Structure Repository." Glycobiology, 23(12): 1422-1424.

10. Wang, S., Xie, W., Zhang, X., Zou, X., and Zhang, Y*. (2012)."Disulfide- and terminal alkyne-functionalized magnetic silica particles for enrichment of azido glycopeptides." Chem Commun (Camb), 48(47): 5907-9.

11. Li, X., Wang, J., Li, W., Xu, Y., Shao, D., Xie, Y., Xie, W., Kubota, T., Narimatsu, H., and Zhang, Y*. (2012)."Characterization of ppGalNAc-T18, a member of the vertebrate-specific Y subfamily of UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases." Glycobiology, 22(5): 602-15.

12. Du, D., Zhu, X., Kuno, A., Matsuda, A., Tsuruno, C., Yu, D., Zhang, Y., Ikehara, Y., Tanaka, Y., Zhang, X., and Narimatsu, H. (2012)."Comparison of LecT-Hepa and FibroScan for assessment of liver fibrosis in hepatitis B virus infected patients with different ALT levels." Clin Chim Acta, 413(21-22): 1796-9.

13. Cheng, Y., Xie, G., Chen, T., Qiu, Y., Zou, X., Zheng, M., Tan, B., Feng, B., Dong, T., He, P., Zhao, L., Zhao, A., Xu, L. X., Zhang, Y. *, and Jia, W. (2012)."Distinct urinary metabolic profile of human colorectal cancer." J Proteome Res, 11(2): 1354-63.

14. Wang, J., Peng, C., and Zhang, Y*. (2011)."Catalytic activity and structure analysis of the intial glycosyltransferase of O-glycosylation." Chin Bull Life Sci 23(7): 619-629.

15. Zhang, X. W., Yan, X. J., Zhou, Z. R., Yang, F. F., Wu, Z. Y., Sun, H. B., Liang, W. X., Song, A. X., Lallemand-Breitenbach, V., Jeanne, M., Zhang, Q. Y., Yang, H. Y., Huang, Q. H., Zhou, G. B., Tong, J. H., Zhang, Y., Wu, J. H., Hu, H. Y., de The, H., Chen, S. J., and Chen, Z. (2010)."Arsenic trioxide controls the fate of the PML-RARalpha oncoprotein by directly binding PML." Science, 328(5975): 240-3.

16. Wang, S., Zou, X., and Zhang, Y*. (2010)."Recent Advances in Mass Spectrometry Based Analysis of Protein O-glycosylation." Prog. Chem., 22(12): 2388-2395.

17. Peng, C., Togayachi, A., Kwon, Y. D., Xie, C., Wu, G., Zou, X., Sato, T., Ito, H., Tachibana, K., Kubota, T., Noce, T., Narimatsu, H., and Zhang, Y*. (2010)."Identification of a novel human UDP-GalNAc transferase with unique catalytic activity and expression profile." Biochem Biophys Res Commun, 402(4): 680-6.

18. Zhang, Q. Y., Mao, J. H., Liu, P., Huang, Q. H., Lu, J., Xie, Y. Y., Weng, L., Zhang, Y., Chen, Q., Chen, S. J., and Chen, Z. (2009)."A systems biology understanding of the synergistic effects of arsenic sulfide and Imatinib in BCR/ABL-associated leukemia." Proc Natl Acad Sci U S A, 106(9): 3378-83.

19. Wei, H., Shen, J., Pang, X., Ding, D., Zhang, Y., Zhang, B., Lu, H., Wang, T., Zhang, C., Hua, X., Cui, L., and Zhao, L. (2008)."Fatal infection in human flora-associated piglets caused by the opportunistic pathogen Klebsiella pneumoniae from an apparently healthy human donor." J Vet Med Sci, 70(7): 715-7.

20. Li, M., Wang, B., Zhang, M., Rantalainen, M., Wang, S., Zhou, H., Zhang, Y., Shen, J., Pang, X., Zhang, M., Wei, H., Chen, Y., Lu, H., Zuo, J., Su, M., Qiu, Y., Jia, W., Xiao, C., Smith, L. M., Yang, S., Holmes, E., Tang, H., Zhao, G., Nicholson, J. K., Li, L., and Zhao, L. (2008)."Symbiotic gut microbes modulate human metabolic phenotypes." Proc Natl Acad Sci U S A, 105(6): 2117-22.

21. Zhang, M., Liu, B., Zhang, Y., Wei, H., Lei, Y., and Zhao, L. (2007)."Structural shifts of mucosa-associated lactobacilli and Clostridium leptum subgroup in patients with ulcerative colitis." J Clin Microbiol, 45(2): 496-500.

22. Li, K., Guan, W., Wei, G., Liu, B., Xu, J., Zhao, L., and Zhang, Y*.(2007)."Phylogenetic analysis of intestinal bacteria in the Chinese mitten crab (Eriocheir sinensis)." J Appl Microbiol, 103(3): 675-82.

23. Shen, J., Zhang, B., Wei, G., Pang, X., Wei, H., Li, M., Zhang, Y., Jia, W., and Zhao, L. (2006)."Molecular profiling of the Clostridium leptum subgroup in human fecal microflora by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis and clone library analysis." Appl Environ Microbiol, 72(8): 5232-8.

24. Cheng, L., Tachibana, K., Iwasaki, H., Kameyama, A., Zhang, Y., Kubota, T., Hiruma, T., Tachibana, K., Kudo, T., Guo, J. M., and Narimatsu, H. (2004)."Characterization of a novel human UDP-GalNAc transferase, pp-GalNAc-T15." FEBS Lett, 566(1-3): 17-24.

25. Zhang, Y., Iwasaki, H., Wang, H., Kudo, T., Kalka, T. B., Hennet, T., Kubota, T., Cheng, L., Inaba, N., Gotoh, M., Togayachi, A., Guo, J., Hisatomi, H., Nakajima, K., Nishihara, S., Nakamura, M., Marth, J. D., and Narimatsu, H. (2003)."Cloning and characterization of a new human UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, designated pp-GalNAc-T13, that is specifically expressed in neurons and synthesizes GalNAc alpha-serine/threonine antigen." J Biol Chem, 278(1): 573-84.

26. Wang, H., Tachibana, K., Zhang, Y., Iwasaki, H., Kameyama, A., Cheng, L., Guo, J., Hiruma, T., Togayachi, A., Kudo, T., Kikuchi, N., and Narimatsu, H. (2003)."Cloning and characterization of a novel UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, pp-GalNAc-T14." Biochem Biophys Res Commun, 300(3): 738-44.

27. Iwasaki, H., Zhang, Y., Tachibana, K., Gotoh, M., Kikuchi, N., Kwon, Y. D., Togayachi, A., Kudo, T., Kubota, T., and Narimatsu, H. (2003)."Initiation of O-glycan synthesis in IgA1 hinge region is determined by a single enzyme, UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2." J Biol Chem, 278(8): 5613-21.

28. Guo, P., Zhang, Y., Zhang, X. Y., Chen, H. L., Zhang, Y., Wang, H., and Narimatsu, H. (2003)."Analysis of lewis antigens on cell surface and alpha1,3 fucosyltransferase subtypes in H7721 human hepatocarcinoma cells." J Exp Clin Cancer Res, 22(1): 135-9.

29. Kudo, T., Iwai, T., Kubota, T., Iwasaki, H., Takayma, Y., Hiruma, T., Inaba, N.,Zhang, Y., Gotoh, M., Togayachi, A., and Narimatsu, H. (2002)."Molecular cloning and characterization of a novel UDP-Gal:GalNAc(alpha) peptide beta 1,3-galactosyltransferase (C1Gal-T2), an enzyme synthesizing a core 1 structure of O-glycan." J Biol Chem, 277(49): 47724-31.

30. Iwai, T., Inaba, N., Naundorf, A., Zhang, Y., Gotoh, M., Iwasaki, H., Kudo, T., Togayachi, A., Ishizuka, Y., Nakanishi, H., and Narimatsu, H. (2002)."Molecular cloning and characterization of a novel UDP-GlcNAc:GalNAc-peptide beta1,3-N-acetylglucosaminyltransferase (beta 3Gn-T6), an enzyme synthesizing the core 3 structure of O-glycans." J Biol Chem, 277(15): 12802-9.

31. Hagiwara, H., Kunihiro, S., Nakajima, K., Sano, M., Masaki, H., Yamamoto, M., Pak, J. W., Zhang, Y., Takase, K., Kuwabara, I., Maruyama, I. N., and Machida, M. (2002)."Affinity selection of DNA-binding proteins from yeast genomic DNA libraries by improved lambda phage display vector." J Biochem, 132(6): 975-82.

32. Guo, J. M., Zhang, Y., Cheng, L., Iwasaki, H., Wang, H., Kubota, T., Tachibana, K., and Narimatsu, H. (2002)."Molecular cloning and characterization of a novel member of the UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase family, pp-GalNAc-T12." FEBS Lett, 524(1-3): 211-8.

33. Gotoh, M., Sato, T., Akashima, T., Iwasaki, H., Kameyama, A., Mochizuki, H., Yada, T., Inaba, N., Zhang, Y., Kikuchi, N., Kwon, Y. D., Togayachi, A., Kudo, T., Nishihara, S., Watanabe, H., Kimata, K., and Narimatsu, H. (2002)."Enzymatic synthesis of chondroitin with a novel chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase that transfers N-acetylgalactosamine to glucuronic acid in initiation and elongation of chondroitin sulfate synthesis." J Biol Chem, 277(41): 38189-96.

34. Cheng, L., Tachibana, K., Zhang, Y., Guo, J., Kahori Tachibana, K., Kameyama, A., Wang, H., Hiruma, T., Iwasaki, H., Togayachi, A., Kudo, T., and Narimatsu, H. (2002)."Characterization of a novel human UDP-GalNAc transferase, pp-GalNAc-T10." FEBS Lett, 531(2): 115-21.

35. Zhang, Y., Pak, J. W., Maruyama, I. N., and Machida, M. (2000)."Affinity selection of DNA-binding proteins displayed on bacteriophage lambda." J Biochem, 127(6): 1057-63.

36. Nakajima, K., Kunihiro, S., Sano, M., Zhang, Y., Eto, S., Chang, Y. C., Suzuki, T., Jigami, Y., and Machida, M. (2000)."Comprehensive cloning and expression analysis of glycolytic genes from the filamentous fungus, Aspergillus oryzae." Curr Genet, 37(5): 322-7.

37. Zhang, Y., Arai, H., Sambongi, Y., Igarashi, Y., and Kodama, T. (1998)."Heterologous Expression of Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c-552 in the Periplasm of Pseudomonas aeruginosa." J. Ferment. Bioeng., 85: 346-349.

38. Kimura, T., Zhang, Y., Kodama, T., and Omor, T. (1996)."Isolation and characterization of Tn 5-induced mutants deficient in carbazole catabolism." FEMS Microbiol. Lett., 135: 65-70.

39. Arai, H., Zhang, Y., Sambongi, Y., Igarashi, Y., and Kodama, T. (1995)."Production of Recombinant Cytochrome c-551 in a Pseudomonas aeruginosa Mutant Strain." J. Ferment. Bioeng., 79: 489-492. 

40. Ouchiyama, N., Zhang, Y., Omor, T., and Kodama, T. (1993)."Biodegradation of Carbazole by Pseudomonas spp. CA06 and CA10." Biosci., Biotechnol., Biochem., 57: 455-460.

代表性中文論文：

1 蛋白質O-GalNAc糖基轉移酶(ppGalNAc-T)的抑制劑研究 劉峰; 許之玨; 吳方; 張延2015中國酶工程與糖生物工程學術研討會論文摘要集 2015-08-21

2 α1-酸性糖蛋白糖鏈檢測對慢乙肝相關肝硬化的早期診斷及其臨床應用 張東華; 朱雪娟; 鄒霞; 張延; 張欣欣; 于德敏 現代免疫學 2015-07-30

3 代謝性標記結合二維電泳尋找O-糖基化蛋白的研究 申浩; 張秀; 張蕾; 張延 生命科學研究 2014-10-30

4 私募股權投資的企業IPO抑價及超額收益分析 張延 上海交通大學 2014-05-24

5 私募股權投資是否提高了目標企業的生產效率——基于中國上市公司的實證分析 費一文; 朱熹; 張延 上海管理科學 2012-10-20

6 O-糖基化起始糖基轉移酶的活性與結構研究 王靜; 彭燦; 張延 生命科學 2011-07-15

7 基于質譜的蛋白質O-糖基化分析 王勝; 鄒霞; 張延 化學進展 2010-12-24

8 結膜松弛癥淚液蛋白質肽質量指紋譜分析 項敏泓; 張興儒; 李青松; 張夢暉; 魯靜; 張群業; 張延 眼科新進展 2010-01-05

9 一種與多肽：N-乙酰氨基半乳糖轉移酶結構類似基因的研究 邵棟; 謝春燕; 程臘梅; 成松久; 張延 2008年全國糖生物學學術會議論文摘要 2008-06-01

10 PCR-DGGE對長江河口八種野生魚類腸道菌群多樣性的比較研究 李可俊; 管衛兵; 徐晉麟; 張延; 趙立平 中國微生態學雜志 2007-06-30

11 膽管結扎對大鼠腸道雙歧桿菌組成的影響 趙琴麗; 龍愛華; 劉平; 龐小燕; 張夢暉; 張延; 趙立平 中國微生態學雜志 2007-04-30

12 輪狀病毒感染對腸道菌群影響的研究 張美玲; 張夢暉; 杜惠敏; 龐小燕; 張延; 趙立平 第二屆中國青年學者微生物遺傳學學術研討會論文集 2006-10-01

13 不同熱劑量的超聲熱療對肝癌動物模型的作用 趙洪; 蔡端; 張延齡; 張群華; 陳亞珠 肝膽外科雜志 2000-06-25

14 利用微生物轉化丙烯腈成丙烯酰胺的研究Ⅱ、產腈水合酶菌種的發酵條件的研究 孫韋強; 張延; 余正齊; 汪莉; 楊鈞; 尹光琳 ; 李族光 石油學報(石油加工) 1989-04-02

15 利用微生物轉化丙烯腈成丙烯酰胺的研究Ⅰ.產腈水合酶菌種的分離篩選和鑒定 孫韋強; 伍登熙; 尹光琳; 余正齊; 李族光; 張剛; 張延; 周建龍; 孫俊; 陸光; 汪莉; 楊芳曉; 楊鈞 石油學報(石油加工) 1988-12-30

來自上海交通大學系統生物醫學研究院的張延研究員介紹了有關《蛋白質的O-糖基化修飾研究》的報告。

張老師首先指出糖鏈修飾是一種重要的蛋白質翻譯后修飾，細胞內50%以上的蛋白質都有糖鏈修飾。糖鏈參與了細胞識別、細胞分化、發育、信號傳導、免疫應答等各種重要生命活動。人類重大疾病如神經退行性疾病、心血管疾病、代謝性疾病、免疫性疾病以及腫瘤等均伴隨有蛋白質糖基化異常的發生。因此蛋白質的糖基化修飾研究是蛋白質組學研究的重要內容。張老師主要通過研究 O-GalNAc糖基轉移酶的糖基化修飾特性，通過利用UDP-GalNAc衍生物糖探針的熒光標記技術，結合質譜及多肽蛋白質芯片技術，建立了一種高通量發現蛋白質O-糖基化的新策略。

來自南京大學化學化工學院的梁靚老師介紹了題為《用于糖蛋白富集的團隊硼親和方法研究》的報告。

目前用于糖蛋白富集的主要方法有凝集素親和法、肼化學法、親水作用色譜法和硼親和色譜法等。硼親和方法與其他幾種方法相比較具有三個顯著的優點：1)共價結合，專一性好，親和力強；2)可逆反應，結合/解吸過程容易控制；3)在酸性條件下解吸，解吸條件的質譜兼容性好。這些優點使得取代硼酸是非常理想的親和配基，特別適合于以質譜為核心的蛋白質組學分析方法。然而，常規的取代硼酸具有兩個明顯的缺點：1)在中性pH下的親和能力極弱，必須在堿性pH下才能與順式二羥基化合物結合，這造成了操作上的不便，增加了樣品變性的危險；2)在堿性pH時取代硼酸帶負電，與樣品及樣品基體間存在靜電相互作用，因而導致專一性的下降。

為了同時解決以上兩個問題，梁老師所在課題組提出了“團隊硼親和”的原理以及相應的方法。利用該方法制備了團隊硼親和磁性納米顆粒和團隊硼親和MALDI靶板，其優異的親和力和專一性得到驗證，成功實現了在中性pH條件下對糖蛋白的專一性富集和純化。

來源：分析測試百科 2010-5-16

花王（中國）研究開發中心有限公司與上海交通大學

近日，花王（中國）研究開發中心有限公司與上海交通大學系統生物醫學研究院共同合作協議的簽字儀式在上海交通大學系統生物研究院順利舉行。花王（中國）研究開發中心有限公司梅本勲總經理與上海交通大學系統生物醫學研究院林志新常務副院長就雙方的研究合作達成一致并簽署協議。宣告了雙方在基礎研究領域開展密切合作，旨在集結雙方先進的研究力量；并將研究成果還原社會。

據悉，此次與花王（中國）研究開心具體開展合作的是上海交通大學系統生物醫學院張延教授所領導的課題小組。張教授在其所在的生物醫學相關領域處于前沿位置。對于與花王的合作，張教授充滿期待。她表示，花王是非常知名的日本企業，研發水平先進。高校的研究不能局限于閉門造車，希望通過與企業的合作將研究成果與實際生活相結合，將成果還原社會，真正地為大眾所用。　　

簽字儀式后，花王（中國）一行還參觀了張延教授的實驗室，花王（中國）負責該項目的基礎研究部荒勝俊部長表示，花王非常高興與中國一流大學的優秀的研究組進行合作，他期待雙方在不久的將來能夠迎來可喜的合作碩果。 

來源：愛美女性網 2012-01-29 

2010年5月15日，蛋白質組數據處理暨全國生物質譜學術交流會”在云南省麗江市召開。會議為期兩天，主要討論了蛋白質組學技術和應用、數據挖掘和生物質譜等方面的現狀及其進展。在所有的大會報告中，除一些關于蛋白質組學技術最新研究進展的大會特邀報告外，第一天的專家報告集中討論了糖蛋白組的最新分析技術與研究進展，第二天的報告集中討論了蛋白質數據處理技術，包括蛋白質組生物數據庫及分析平臺的構建、數據統計分析方法的研究等方面。

作為會議議題的主要內容之一，糖蛋白廣泛存在于生物體內，是重要的生物活性物質，具有很多重要功能，關于其的最新研究進展已受到國內外科學家們的高度關注。在本次大會上，南京大學的梁亮博士、美國約翰霍普金斯大學李巖博士、上海交通大學系統生物醫學研究院的張延研究員等多位專家學者作了關于糖蛋白最新研究進展的報告。

報告題目：蛋白質的O-糖基化修飾研究

報告人：上海交通大學系統生物醫學研究院張延研究員

糖鏈修飾是一種重要的蛋白質翻譯后修飾。細胞內50%以上的蛋白質都有糖鏈修飾。糖鏈參與了細胞識別、細胞分化、發育、信號傳導、免疫應答等各種重要生命活動。按糖鏈與氨基酸的糖苷鍵結合方式的不同，真核生物中蛋白質糖基化可分為N-糖基化修飾和O-糖基化修飾，蛋白質的O-糖基化修飾中最主要的O-GalNAc修飾。

張延研究員通過對O-GalNAc糖基轉移酶的糖基化修飾特性進行研究，利用UDP-GalNAc衍生物糖探針的熒光標記技術，結合質譜及多肽蛋白質芯片技術，建立了一種高通量發現蛋白質O-糖基化的新策略。

來源：儀器信息網 2010/5/19

榮譽獎勵：

2007年，入選上海浦江人才。

歐洲蛋白質組學協會的Jounal of Proteomics雜志近日在線發表了上海交通大學系統生物醫學研究院張延課題組通過血清蛋白質組學手段尋找結直腸癌相關標志物研究的最新成果。

 

該研究運用相對定量血清蛋白質組學和分子生物學研究技術，系統性地解析了不同分期結直腸癌病人血清、組織樣本中細胞外基質組分--I型膠原蛋白在結直腸癌發生發展中的生物學行為。首次發現腫瘤病人血清中I型膠原蛋白的代謝性降解產物羧基末端肽（CTx）的含量與結直腸癌病人的分期呈正相關，血清中CTx的變化與病人的預后生存期相關。表明血清中CTx標志物檢測對結直腸癌預后的臨床診斷具有參考意義。研究提示伴隨腫瘤生長所產生的代謝性特異降解多肽片段，是未來血清腫瘤生物標志物發現的重要目標候選分子群。研究同時為血清蛋白組學手段在臨床檢測上的應用提供了功能組織學佐證。 

該研究由張延課題組與上海交大醫學院附屬瑞金醫院鄭民華教授課題組共同合作完成。第一作者為博士生鄒霞和馮波醫生。

附：文章鏈接 http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874391913005356