邱中建在1957年是石油系統最早進入松遼盆地的石油地質工作者，對該盆地進行綜合研究后，指出包括大慶油田在內的盆地主體極有含油遠景，參與了大慶油田發現井的技術論證及該井的現場試油，是大慶油田發現者之一，獲國家自然科學一等獎。60年代參加山東勝利油田會戰，對發現及評價勝坨大型油田做出了貢獻。后期參加四川會戰，成功評價了威遠等大型氣田并在瀘州一帶發現了一批氣田。70年代整體研究渤海灣，通過整體解剖指出渤海灣主要斷裂構造帶是多種油藏組成的復合體，并與同志們合作首次提出復式油氣聚集區（帶）的概念。渤海灣復式油氣聚集區（帶）理論與實踐獲國家科技進步特等獎，他是主要參加者。80年代組織并參與海洋石油對外合作，學習借鑒國外油氣資源評價方法，并對珠江口盆地進行評價，合作發現流花及惠州等大中型油田，該方法已在全國推廣。同時通過自營勘探在遼東灣發現綏中36等大油田，并獲國家科技進步二等獎。90年代組織領導了塔里木石油會戰，發現了塔中、哈得遜、牙哈等大中型油氣田。同時對山地地震、山地深井鉆探、高壓地層測試及建立氣藏模式等一系列關鍵技術進行攻關并取得突破，成功地發現了我國巨大的天然氣富集區及克拉2等大型氣田，為“西氣東輸”工程奠定了資源基礎，獲國家科技進步一等獎。他組織領導了塔里木“八五”油氣資源科技攻關及成功修建“死亡之海”沙漠公路，被評為國家“八五”科技攻關十大成果之一。

1989年獲人事部“中青年有突出貢獻專家”稱號。1991年獲中國石油天然氣總公司“有突出貢獻科技專家”獎章。1999年當選為中國工程院院士。