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世界首個棗全基因組測序在河北農業大學完成

世界首個棗全基因組測序在河北農業大學完成
 
日期:2014年11月05日      河北省科技廳

 

    河北省杰出青年科學基金項目獲得者河北農業大學劉孟軍教授帶領其研究團隊歷時3年多時間完成了世界首個棗全基因組測序,測序研究成果于10月29日被國際權威科學雜志《自然通訊》(Nature Communications)在線發表。這標志著中國在棗基因組學研究方面達到了國際領先水平。該研究使棗樹成為世界鼠李科植物中首個完成基因組測序的物種,為鼠李科及其它果樹和木本植物的分子遺傳改良提供了十分重要的理論借鑒。
    棗的基因組屬于高度復雜的類型,其測序和組裝的難度很大。劉孟軍教授帶領其棗研究團隊在第二代測序技術基礎上,綜合采用BAC-to-BAC和WGS-PCR-free方法,成功開展了對我國著名棗品種“冬棗”的全基因組測序工作,組裝出高質量的棗基因組序列,總長達4.38億個堿基,占預估棗基因組大小的98%,同時將其中80%的序列錨定到了棗的12條假染色體上。該研究還注釋出32000多個基因,這里面包含大量的棗特色基因。特別是在第一號染色體上,發現了一段高度保守的區域,這一段和抗逆、多糖代謝相關,為棗的特殊生物學性狀的分析提供了重要線索。
    棗果是世界上已知維生素C含量最為豐富的果品之一,比蘋果、梨高出數十倍,甚至超過人們所熟知的富含維生素C的柑橘和獼猴桃,但棗果大量積累維生素C的內在機制一直是個謎。劉孟軍團隊通過大量的比較基因組和轉錄組的分析發現,棗同時具有了柑橘和獼猴桃兩種積累維生素C的分子機制,這在其他果樹中是沒有見到的。此外,本研究還揭示了棗樹抗旱、耐鹽以及“落枝歸根”而非“落葉歸根”等獨特和優異性狀形成的分子機制。
    河北農業大學該項研究成果的問世,將對揭開棗樹進化和生長發育之謎、加速棗樹功能基因組學研究、促進棗樹乃至鼠李科和其他果樹的遺傳改良和分子育種等工作產生重大而深遠的影響。
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