大豆、油菜、花生等作物，不僅是我國人民食用植物油和蛋白質的重要來源，還是發展畜牧養殖業的重要優質蛋白源，在我國國民經濟和社會發展中具有十分重要的地位。在國家863計劃的資助下，經過兩年半努力，“大豆、油菜、花生功能基因組學研究與應用”課題組取得了重要的階段性成果。2015年6月4日，863計劃現代農業技術領域辦有關工作人員組織主題專家和財務專家對該課題進行了中期現場檢查，項目首席專家喻樹迅院士參加了檢查。
       “大豆、油菜、花生功能基因組學研究與應用”課題組織實施兩年多來，課題組以功能基因組研究為依托，在新分子標記開發、重要功能基因克隆與應用及種質資源創制等方面取得了較大突破：在新分子標記開發方面，課題組開展了油菜、大豆、花生多種性狀的QTL分析，精細定位了重要性狀基因位點40多個，篩選獲得新分子標記250多個，并應用分子標記技術完成了油菜、大豆、花生導入系和突變體的創制與評價；在重要功能基因克隆方面，課題組課題組通過圖位克隆技術獲得了18個油菜、大豆重要功能基因，特別是通過精細定位，課題組鑒定出一個油菜粒重調控基因RSW1, 該基因屬于生長素應答因子，可以通過抑制生長素下游基因影響細胞生長, 過量表達該基因可以改變種子重量和角果長度，該研究結果為油菜高產品種選育提供了重要理論基礎和技術支撐，課題組還發現油菜的BnC3CCD4基因變異決定了花色差異，該類胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因的突變導致花瓣中黃色類胡蘿卜素不能降解，進而積累成黃色花瓣，該成果揭示了蕓薹屬物種花色形成的分子機理，為通過基因工程手段選育多花色油菜品種，發展觀光農業奠定了基礎；在種質資源創制方面，課題組應用分子標記輔助選擇技術培育出大豆和花生新品系各2個，并通過遺傳轉化獲得了表型好、應用前景廣的轉基因油菜、大豆品系3個，為課題后續新品種選育奠定了良好的基礎。
       專家組認為，課題組在建立油料作物分子設計育種平臺，發掘油料作物高產、高抗功能基因及分子標記方面取得了重要階段性成果，為培育油料作物新品種，緩解國內食用油供給不足奠定了良好基礎，同時，專家組指出課題組應進一步加強課題內部交流合作，突出研突出重點，加強重大成果的培育。