我國是世界桃起源中心，保存有世界上份數最多的桃種質，桃在我國的栽培面積和產量遠高于其他國家，在果品生產中具有重要地位。為進一步發掘優異桃種質資源，建立桃分子育種平臺，十二五期間，國家863計劃啟動了“特色果樹功能基因組學研究與應用”課題。6月5日863計劃領域辦組織相關專家對課題進行了中期檢查。
      “特色果樹功能基因組學研究與應用”課題在研究初期，重點瞄準爭議較大的桃進化路線問題展開研究，通過對84份桃種質的基因組重測序分析，課題組確定了普通桃的進化始于光核桃，之后為山桃，再次為甘肅桃，最終形成普通桃的進化路線，明確了新疆桃只是普通桃的一個地理類群，相關研究結果發表在《基因組生物學》（Genome Biology）上。通過基因組學的研究，課題組發現與野生近緣種相比，雖然普通桃的單核苷酸多態性位點（SNPs）只有野生桃的62.0%，但在這些SNPs中，普通桃特有SNPs占到其總SNP的47.3%，該結果很好的解釋了桃總體多樣性低，但特異性狀豐富的矛盾�；�于以上的研究結果，目前課題組正在利用全基因組關聯分析手段挖掘與桃主要農藝性狀相關的基因和分子標記，在對雜交育種群體進行初步驗證后發現大部分質量性狀標記的準確率可達到90%以上，在未來3-5年內，利用該項技術研制的基因芯片可在桃常規育種中應用推廣，將顯著縮短我國桃的育種周期，加快主栽品種的更新換代，對提升我國果品在世界桃市場上的占有率、促進農民增收具有重要意義。
      檢查期間，專家組認真聽取了課題匯報，實地考察了課題種質資源圃及實驗室，并審查了相關材料，專家組認為該課題執行兩年來，在特色果樹的種質表型精準評價、物種進化、分子標記及優異基因挖掘、代謝調控網絡分析等方面進行了大量的研究，取得了重要階段性成果，為課題研究目標的實現奠定了良好的材料基礎和工作基礎。同時，專家組指出，課題組應加強內部交流合作，加快搭建基因組學與育種高效應用技術平臺，并進一步凝練思路，加強重大成果的培育。